שימוש במיקרוסקופים רגילים
1. תצפית בהגדלה נמוכה
ראשית, תקן את המיקום של עדשת האובייקטיב בעוצמה נמוכה, לאחר מכן הנח את חלק הדגימה, סובב את המשקף, כוונן את האור, הרם את עדשת האובייקטיב, כוונן אותה כלפי מטה כדי לראות את הדגימה, ולאחר מכן יישר אותה עדין עם אורך המוקד עבור תַצְפִּית. למעט כמה מיקרוסקופים, יש למקם את מיקום המעבה בנקודה גבוהה. אם מופיעה תמונה של אובייקט חיצוני בשדה הראייה, ניתן להנמיך מעט את הזרקור והתמונה יכולה להיעלם. יש להתאים את צמצם הקשתית מתחת לזרקור לגודל מתאים כדי לשלוט בכמות האור הנכנס ולהגדיל את הפרש הבהירות.
2. תצפית בהגדלה גבוהה
העיצוב של מיקרוסקופ הוא בדרך כלל קונפוקאלי. לאחר שהמראה בעוצמה נמוכה מיושרת עם הפוקוס, ניתן להחליף אותה למראה בעוצמה גבוהה שבעצם מיושרת עם הפוקוס, כל עוד היא מסובבת מעט ומכווננת עדין. כמה מיקרוסקופים פשוטים אינם קונפוקאליים, או אינם יכולים להשיג קונפוקאליים עקב החלפת עדשת האובייקטיב. לכן, יש צורך להזיז את עדשת האובייקטיב החזקה מטה ולאחר מכן להתאים את הפוקוס כלפי מעלה. יש להגדיל את פתח הקשתית כדי ליצור זווית חרוט מספקת. הזז את הזרקור מעט למעלה ולמטה כדי לראות אם התמונה ברורה.
3. תצפית מראת טבילה בשמן
מרחק העבודה של עדשות טבילה בשמן קטן מאוד, ולכן יש צורך למנוע נזק לעדשות על גבי העדשות והאובייקטיב. בשימוש, הוא מושג בדרך כלל באמצעות הגדלה נמוכה, הגדלה גבוהה ומראות טבילה בשמן. לאחר יישור המטרה בעלת העוצמה הגבוהה עם הדגימה, שמן והטבל את העדשה לצורך תצפית. ניתן גם לצפות בדגימת השקופית ישירות באמצעות מיקרוסקופ טבילה בשמן מבלי לעבור עדשות אובייקטיביות בהגדלה נמוכה וגבוהה. אם למיקרוסקופ יש מתקן לעצור נפילה אוטומטית, לאחר הוספת שמן לשקופית, הזיזו את מראת טבילת השמן למטה לתוך טיפת השמן עד שתפסיק ליפול, ולאחר מכן כוונן את הפוקוס כלפי מעלה בהתאמה עדינה. אם אין מכשיר ירידה אוטומטית, השיטה ליישור הפוקוס היא לצפות מהצד של המיקרוסקופ, להזיז את מראת טבילת השמן כלפי מטה עד שהיא נוגעת מעט במגלשת הזכוכית, ולאחר מכן להשתמש בכוונון עדין כדי להעלות את הפוקוס כלפי מעלה.
בעת שימוש במראות טבולות בשמן, יש לשמור על שולחן המראות אופקי כדי למנוע זרימת שמן.
השמן המשמש במראה הטבילה בשמן צריך להיות נקי, ויש להעלות את הקבל לנקודה גבוהה ולהגדיל את פתח הקשתית מתחת למעבה, אחרת הצמצם המספרי יקטן והרזולוציה תיפגע. בין אם מתבוננים בעדשת טבילה בשמן ובין אם בעדשה בעוצמה גבוהה, רצוי להשתמש במנורת מיקרוסקופ מתכווננת כמקור האור.
