יתרונות משופרים של מיקרוסקופים מולטיפוטונים בסריקת לייזר
מיקרוסקופ רב-פוטוני סורק בלייזר הוא שיפור משמעותי של מיקרוסקופיה אופטית, המתבטא בעיקר ביכולת לצפות במבנים עמוקים של תאים חיים, תאים קבועים ורקמות, ולהשיג מבנים רב-שכבתיים חד-שכבתיים של Z-, כלומר פרוסות אופטיות, שניתן להשתמש בהן לבניית מבנים מוצקים תלת--מימדיים. מיקרוסקופ קונפוקאלי משתמש במקור אור לייזר, אשר מורחב כדי למלא את כל מישור המוקד של עדשת האובייקט, ולאחר מכן מתכנס לנקודות קטנות מאוד במישור המוקד של הדגימה דרך מערכת העדשות של עדשת האובייקט. לפי הצמצם המספרי של עדשת האובייקטיב, הקוטר של נקודת ההארה הבהירה ביותר הוא בערך 0.25-0.8 מיקרומטר, והעומק הוא בערך 0.5-1.5 מיקרומטר. גודל הנקודה הקונפוקלית נקבע על ידי עיצוב המיקרוסקופ, אורך גל הלייזר, מאפיינים אובייקטיביים, הגדרות מצב יחידת הסריקה ומאפייני הדגימה. טווח ההארה והעומק של מיקרוסקופ שדה גדולים, בעוד שהתאורה של מיקרוסקופ קונפוקאלי ממוקדת בנקודת מוקד במישור המוקד. היתרון הבסיסי של מיקרוסקופיה קונפוקלית הוא בכך שהיא יכולה לבצע חתך אופטי עדין על דגימות פלורסנט עבות (עד 50 מיקרומטר או יותר), בעובי של כ-0.5 עד 1.5 מיקרומטר. ניתן לקבל את סדרת תמונות הפרוסות האופטיות על ידי הזזת הדגימה למעלה ולמטה באמצעות מנוע הצעד של ציר Z- של המיקרוסקופ. איסוף מידע התמונה נשלט בתוך המישור * *, ללא הפרעות מאותות הנפלטים ממיקומים אחרים על הדגימה. לאחר הסרת השפעת הקרינה ברקע והגדלת יחס האות לרעש, הניגודיות והרזולוציה של תמונות קונפוקאליות משופרים משמעותית בהשוואה לתמונות הקרינה המסורתיות של תאורת שדה. בדגימות רבות, רכיבים מבניים מורכבים משתלבים זה בזה כדי ליצור מערכות מורכבות, אבל ברגע שניתן לאסוף מספיק קטעים אופטיים, נוכל להשתמש בתוכנה כדי לשחזר אותם בתלת מימד. שיטה ניסיונית זו הייתה בשימוש נרחב במחקר ביולוגי כדי להבהיר את הקשרים המבניים והתפקודיים המורכבים בין תאים או רקמות.
