מיקרוסקופי פלואורסצנטי מסווגים לשני סוגים על סמך הנתיבים האופטיים שלהם:
1. מיקרוסקופ פלואורסצנטי שידור: מקור אור העירור משמש לעורר פלואורסצנטי על ידי מעבר דרך חומר הדגימה דרך עדשת מעבה. ניתן להשתמש גם ברכזי שדות כהים בשימוש נפוץ, וניתן להשתמש ברכזים רגילים כדי להתאים את המשקף כדי לנתב מחדש ולהעביר את אור העירור אל הדגימה. זהו מיקרוסקופ פלואורסצנטי מיושן יחסית-. היתרון שלו הוא הקרינה חזקה בהגדלה נמוכה, אך חסרונו הוא שהקרינה שלו פוחתת עם הגדלת ההגדלה. לכן, עדיף להתבונן בחומרי דגימה גדולים יותר.
2. מיקרוסקופ פלואורסצנטי נופל הוא סוג חדש של מיקרוסקופ פלואורסצנטי שפותח בתקופה המודרנית. שלא כמו האמור לעיל, אור העירור נופל מעדשת האובייקטיב כלפי מטה על פני הדגימה, תוך שימוש באותה עדשת אובייקטיבית כמו מעבה התאורה ועדשת האובייקטיב לאיסוף הקרינה. צריך להוסיף מפצל אלומה כפול לנתיב האופטי, שנמצא במרחק של 45 מעלות מהאורניום הקל. זווית, אור העירור מוחזר לתוך עדשת האובייקטיב ומתמקד בדוגמה. הקרינה הנוצרת על ידי הדגימה, כמו גם אור העירור המוחזר מפני השטח של עדשת המטרה וזכוכית הכיסוי, נכנסים לעדשת המטרה וחוזרים למפצל האלומה הכפול, ומפריד בין אור העירור לבין הקרינה. אור העירור השיורי נספג לאחר מכן על ידי המסנן החוסם. אם נעשה שימוש בשילובים שונים של מסנני עירור/מפרידי אלומה בצבע כפול/מסנני חסימה, הם יכולים לענות על הצרכים של תוצרי תגובה פלורסנטית שונים. היתרונות של מיקרוסקופ פלואורסצנטי זה הם תאורת שדה אחידה, הדמיה ברורה וקרינה חזקה יותר עם הגדלה גדולה יותר.
(2) הוראות לשימוש במיקרוסקופ פלואורסצנטי
1. הפעל את מקור האור. יש לחמם מראש את מנורת הכספית האולטרה-גבוהה למשך מספר דקות כדי להגיע לבהירות המקסימלית שלה.
2. מיקרוסקופ פלואורסצנטי שידור מחייב התקנת מסנן העירור הנדרש בין מקור המנורה למעבה, ואת מסנן החסימה המתאים מאחורי עדשת האובייקטיב. מיקרוסקופ פלואורסצנטי האור הנופל צריך להכניס את מסנן העירור הדרוש/מפצל קרן קרן כפול/גוש מסנן חוסם לתוך החריץ של הנתיב האופטי.
3. התבוננו במיקרוסקופ- בהספק נמוך והתאם את מרכז מקור האור בהתאם למכשיר הכוונון של סוגים שונים של מיקרוסקופים פלואורסצנטיים, כך שהוא ממוקם במרכז כתם ההארה כולו.
4. הנח את הדגימה ומקד אותה לצורך התבוננות. יש לשים לב במהלך השימוש: אין להתבונן ישירות עם העיניים לפני התקנת המסנן כדי למנוע נזק לעיניים; בעת התבוננות בדגימות עם מיקרוסקופ שמן, יש להשתמש במיקרוסקופ שמן מיוחד שאינו ניאון; לאחר כיבוי מנורת הכספית בלחץ גבוה-, לא ניתן להדליק אותה מיד. זה לוקח 5 דקות להפעיל מחדש, אחרת זה יהיה לא יציב וישפיע על אורך החיים של מנורת הכספית.
(3) התבוננות תחת מיקרוסקופ פלואורסצנטי על פלטפורמת הוראה באמצעות מסנן אור סגול כחול, ניתן לראות תאים מוכתמים בצבע ניאון כתום אקרידין 0.01%. הגרעין והציטופלזמה נרגשים לייצר שני צבעים שונים של קרינה (ירוק כהה ואדום כתום).
