ההבדל בין מיקרוסקופיה של שני פוטונים למיקרוסקופיה לייזר קונפוקלית
מיקרוסקופ קונפוקאלי לייזר הוא קבוצה של מערכת תצפית, ניתוח ופלט המשתמשת בלייזר כמקור אור, מאמצת עיקרון מיקוד מצומד והתקן על בסיס מיקרוסקופ אופטי מסורתי, ומשתמשת במחשב כדי לעבד תמונה דיגיטלית של האובייקט הנצפה. המערכת הראשית כוללת מקור אור לייזר, מיקרוסקופ אוטומטי, מודול סריקה (כולל ערוץ נתיב אופטי קונפוקאלי וחור חריר, מראת סריקה, גלאי), מעבד אותות דיגיטלי, ציוד פלט מחשב ותמונה (צג, מדפסת צבעונית) ועוד. דרך סריקת הלייזר מיקרוסקופ קונפוקאלי, ניתן לסרוק את דגימת התצפית בצורה טומוגרפית ולהצטלם. לכן, ניתן לצפות ולנתח את המבנה המרחבי התלת מימדי של תאים ללא נזק.
במקביל, המיקרוסקופ הקונפוקאלי סריקת הלייזר הוא גם כלי רב עוצמה לתצפית דינמית בתאים חיים, תיוג אימונופלואורסצנטי מרובה ותצפית תיוג קרינת יונים. זה יכול לנתח במדויק את אופי הספקטרום ולהבחין בין האותות של תוויות שונות עם ספקטרום פליטה חופף מאוד.
והכי חשוב, עבור צביעה פלורסנטית רב-צבעית, זה יכול לבטל לחלוטין את ההשפעה של צלב-צבע ניאון, ובאותו הזמן למזער את אובדן אות הקרינה המדגם. אלו דברים שמיקרוסקופי אור רגילים לא יכולים להשיג.
