מבוא למה יש צורך במיקרוסקופ קונפוקאלי
1. המיקרוסקופ האופטי השתכלל באמצעות המאמצים והשיפורים של קודמינו הגדולים. למעשה, מיקרוסקופים קונבנציונליים יכולים לספק לנו תמונות מיקרוסקופיות יפות בפשטות ובמהירות. עם זאת, התרחש אירוע שהביא חדשנות מהפכנית לעולם הכמעט מושלם זה של מיקרוסקופים, שהיה המצאת "המיקרוסקופ הקונפוקאלי הסורק בלייזר". המאפיין של סוג חדש זה של מיקרוסקופ הוא השימוש במערכת אופטית השואבת רק את מידע התמונה על פני השטח שבו הפוקוס מרוכז. על ידי שינוי המיקוד ושחזור המידע שהתקבל בזיכרון התמונה, ניתן לקבל תמונה חיה עם מידע תלת מימדי מלא. באמצעות שיטה זו ניתן להשיג בקלות מידע על צורת פני השטח שלא ניתן לאשר באמצעות מיקרוסקופים קונבנציונליים. בנוסף, עבור מיקרוסקופים אופטיים טיפוסיים, "שיפור רזולוציה" ו"העמקת עומק המוקד" הם תנאים סותרים, במיוחד בהגדלה גבוהה. עם זאת, עבור מיקרוסקופים confocal, בעיה זו נפתרת בקלות.
המערכת האופטית הקונפוקלית מספקת תאורה נקודתית לדוגמא, בעוד שהאור המוחזר נקלט גם על ידי חיישן נקודתי. כאשר הדגימה ממוקמת במיקום המוקד, כמעט כל האור המוחזר יכול להגיע לפוטורצפטור. כאשר הדגימה סוטה מנקודת המוקד, האור המוחזר אינו יכול להגיע לפוטורצפטור. כלומר, במערכת אופטית קונפוקלית, רק התמונה החופפת לנקודת המוקד תוצא, והאור המפוזר הנקודתי והחסר תועלת ייחסם.
במערכת אופטית קונפוקלית, מופעלת תאורה נקודתית על המדגם, והאור המוחזר נקלט גם על ידי חיישן נקודתי. לכן, מקורות אור נקודתיים הופכים נחוצים. לייזר הוא מקור אור מאוד נקודתי. ברוב המקרים, מקור האור של מיקרוסקופיה קונפוקלית הוא מקור אור לייזר. בנוסף, המונוכרומטיות, הכיווניות וצורת האלומה המצוינת של לייזרים הם גם סיבות חשובות לאימוץ הנרחב שלהם.
