מיקרוסקופים פלואורסצנטיים מחולקים לשני סוגים המבוססים על נתיבי האור שלהם:
1. מיקרוסקופ פלואורסצנציה של העברה: מקור אור העירור משמש לרגש את הקרינה על ידי מעבר דרך חומר הדגימה דרך עדשת הקבל. ניתן להשתמש בריכוזי שדה כהים נפוצים, וניתן להשתמש בריכוזים רגילים כדי להתאים את המשקף להפניה מחדש ולצדק את אור העירור על הדגימה. זהו מיקרוסקופ פלואורסצנטי מיושן יחסית. היתרון שלו הוא פלואורסצנציה חזקה בהגדלה נמוכה, אך החיסרון שלו הוא שהפלואורסצנטיות שלו פוחתת עם הגדלת ההגדלה. לכן עדיף להתבונן בחומרי דגימה גדולים יותר.
2. מיקרוסקופ פלואורסצנט אור נופל הוא סוג חדש של מיקרוסקופ פלואורסצנטי שפותח בתקופה המודרנית. בניגוד לאמור לעיל, אור העירור נופל מהעדשה האובייקטיבית כלפי מטה אל פני הדגימה, תוך שימוש באותה עדשה אובייקטיבית כמו מעבה התאורה והעדשה האובייקטיבית לאיסוף הקרינה. יש להוסיף מפצל קרני צבע כפול לנתיב האופטי, שנמצא 45 מעלות מלבד האורניום הקל. זווית, אור העירור בא לידי ביטוי בעדשה האובייקטיבית וממוקד במדגם. הקרינה הנוצרת על ידי הדגימה, כמו גם אור העירור המשתקף משטח העדשה האובייקטיבית וכיסוי זכוכית, נכנסים לעדשה האובייקטיבית וחוזרים למפצל קרן הצבע הכפול, ומפריד בין אור העירור והקרינה. לאחר מכן נספג אור העירור הנותר על ידי פילטר החוסם. אם משתמשים בשילובים שונים של מסנני עירור/מפרידי קרן צבע כפולים/מסנני חסימה, הם יכולים לענות על הצרכים של מוצרי תגובה פלואורסצנטיים שונים. היתרונות של מיקרוסקופ פלואורסצנטי זה הם תאורת שדה אחידה, הדמיה ברורה וקרינה חזקה יותר עם הגדלה גדולה יותר.
הוראות לשימוש במיקרוסקופ פלואורסצנטי.
1. הפעל את מקור האור, יש לחמם מראש את מנורת הכספית הלחץ הגבוה במיוחד למשך מספר דקות כדי להגיע לנקודה המוארת.
2. מיקרוסקופיית פלואורסצנציה של העברה מחייבת התקנה של מסנן העירור הנדרש בין מקור המנורה לקבל, ומסנן החסימה המתאים מאחורי העדשה האובייקטיבית. מיקרוסקופ הקרינה האור הנופל צריך להכניס את מסנן העירור הנדרש/מפצל קרן צבע כפול/חסימת מסנן חוסמת לחריץ הנתיב האופטי.
3. שימו לב עם מיקרוסקופ בעל כוח נמוך והתאם את מרכז מקור האור בהתאם למכשיר ההתאמה של סוגים שונים של מיקרוסקופי פלואורסצנציה, כך שהוא ממוקם במרכז כל נקודת ההארה.
4. מקם את הדגימה וממקד אותה לתצפית. יש לשים לב במהלך השימוש: אל תבחין ישירות בעיניים לפני שתתקין את המסנן כדי למנוע נזק לעיניים; בעת התבוננות בדגימות עם מיקרוסקופ שמן, יש להשתמש במיקרוסקופ שמן מיוחד שאינו פלורסנט; לאחר כיבוי מנורת הכספית בלחץ גבוה, לא ניתן להפעיל אותה מייד לאחור. לוקח 5 דקות להפעלה מחדש, אחרת זה לא יהיה יציב וישפיע על אורך החיים של מנורת הכספית.






