מיקרוסקופ בסיסי
זה נחשב למיקרוסקופ המקורי. במאה השבע עשרה, לוונהוק המציא אותו. שולבו עדשות ומסגרות קמורות. מינים מיוחדים יכולים להיות מוגדלים פי 200-300 (יותר כמו זכוכית מגדלת). מכיוון שהם יכולים לחשוף מידע על חומר ביולוגי, מיקרוסקופים הם כלים פשוטים להפליא אך יעילים ביותר.
מיקרוסקופ בסיסי משמש שענים כדי לראות ולהגדיל חלקי שעון קטנים. הוא משמש גם על ידי מומחים בתעשיית התכשיטים והעור. תמונות של אותיות בספרים, טקסטורות של סיבים וחוטים, ופרטים עדינים יותר של חותמות וחריטות, כולם ניתנים להגדלה בטכניקה זו. מאז המצאת מיקרוסקופים אחרים עם עדשה שנייה, המשפרת את איכות התמונה, כבר לא נעשה שימוש במיקרוסקופים בסיסיים.
מיקרוסקופ בקנה מידה אטומי
במיקרוסקופ מורכב, מנורה הממוקמת מתחת מאירה את השקופית. שתי עדשות - אחת ליד השקף, המכונה המטרה, ואחת ליד החלק העליון, המכונה עינית - משמשות להגדלת הדגימה. הם מציעים תמונה דו מימדית הניתנת לשינוי בהתאם לעוצמת העדשה.
מיקרוסקופים מורכבים מגיעים במגוון עיצובים אך לרוב הם בסיסיים למדי, מה שהופך אותם לפשוטים לתפעול עבור כל אחד. היתרון של מיקרוסקופים מורכבים הוא שהם עשויים להיות מוגדלים להגדלות גדולות יותר והם זולים עבור סטודנטים, חובבים ומדענים. הרזולוציה הפחותה שלהם פירושה שבדומה למיקרוסקופים מתוחכמים יותר, התמונה לעולם לא תהיה חדה.
מערכת הדמיה ניאון
המדען הבריטי ג'ורג' ג'י סטוקס הגדיר את הקרינה במקור בשנת 1852. כאשר הבחין שהמינרל פלואורספאר זורח באדום כשהוא מופעל על ידי אור UV, הוא מצא את השם "פלורסצנטי". הוא הדגיש שלפליטת הקרינה יש אורך גל ארוך יותר מאשר אור עירור. מכיוון שהוא יכול לראות את הקרינה המופקת על ידי מולקולות המטרה, מיקרוסקופ פלואורסצנטי היא טכניקה ייחודית. לשם כך, מוסיפים כימיקלים פלורסנטים מסוימים לתאי המטרה, וגורמים להם להאיר כאשר אור עירור מאיר עליהם.
האוטופלואורסצנטיות של חומרים כמו כלורופיל, ויטמין A, קולגן, ריבופלבין וכו' מאפשרת התבוננות בהם במיקרוסקופ זה ללא החדרת פיגמנטים פלואורסצנטיים. גם רכיבים אחרים כגון תאית, גליקוגן, חלבונים, פחמימות וכרומוזומי Y צריכים להיות מוכתמים באמצעות צבעים פלורסנטים. ניתן לראות חלבונים ספציפיים בתאים באמצעות צבעים ניאון.
מיקרוסקופ עם confocals
בניגוד למיקרוסקופ סטריאו ומורכב, מיקרוסקופיה קונפוקלית משתמשת באור נראה ממקור לייזר. על מנת לסרוק את הדגימה בלייזר ולשלב את התמונה המתקבלת למחשב להקרנת מסך, למיקרוסקופים יש מספר מראות סריקה. למיקרוסקופ המדובר חסרות עיניות. הם מציעים תמונה דו מימדית הניתנת לשינוי בהתאם לעוצמת העדשה.
המילה "קונפוקל" מתייחסת לאופן שבו מיקרוסקופ זה מבטל אותות לא ממוקדים בניגוד למיקרוסקופ פלואורסצנטי באמצעות תאורה נקודתית וחורים במישור מצומד אופטית מול הגלאי. הרזולוציה האופטית של התמונה גבוהה במידה ניכרת מאשר במיקרוסקופיה בשדה רחב מכיוון שניתן לזהות אור פלואורסצנטי רק קרוב מאוד למישור המוקד. עם זאת, מכיוון שהחור חוסם את רוב האור של הקרינה המדגם, הרזולוציה הגדולה יותר באה על חשבון אות חלש יותר, המחייבת חשיפות ממושכות.
מיקרוסקופ אלקטרוני
בשנת 1986 נוצר המיקרוסקופ הדיגיטלי ביפן. הוא עושה שימוש במחשב כדי לתפוס דברים שהעין האנושית לא יכולה. ניתן למצוא אותם עם או בלי עיניות. ניתן לחבר אותו לצג מחשב באמצעות כבל USB. ניתן להציג אותו כדוגמה מורחבת על מסך מחשב בעזרת תוכנת מחשב. ניתן לצלם ולשמור בזיכרון המחשב גם תמונות סטילס וגם צילומים נעים. דואר אלקטרוני מאפשר אחסון לטווח ארוך יותר של תמונות מאוחסנות. חוקרים, סטודנטים, חובבנים ויצרנים יכולים כולם להשתמש בו.
